BCI               package:unknown                R Documentation

NDICE DE CONDIO CORPREA EM CETCEOS (BCI)

Description:

     A funo calcula o ndice de condio corprea (Body Condition Index) de grandes cetceos (a partir de medidas feitas por sobrevoo de drones) e classifica os animais em adultos ou imaturos de acordo com esse ndice.

Usage:

     BCI (baleias, ad=TRUE, Megaptera=FALSE, rmNA=FALSE)

Arguments:

 baleias: objeto da classe data.frame que contenha pelo menos 5 colunas de dados

 ad: argumento lgico. Se TRUE retorna um array com os indivduos da classe adulto e seus respectivos ndices. Se FALSE retorna um array com os indivduos da classe imaturo e seus respectivos ndices

Megaptera: argumento lgico. Se TRUE ir trabalhar apenas com os animais do gnero do artigo base (Megaptera). Se FALSE ir trabalhar com todos os gneros disponveis na planilha

rmNA: argumento lgico. Se TRUE exclui as linhas contendo NAs. Se FALSE mantm as linhas com NAs nos clculos
 
Details:
     O clculo de ndice de condio corprea  feito dividindo a superfcie do corpo do animal em segmentos trapezoidais e fazendo a somatria da rea desses segmentos. Sendo assim o data.frame precisa de medidas especificas em metros para serem realizados os clculos

     Como a funo trabalha com medidas especficas  necessrio que o objeto de entrada data.frame contenha nas colunas 3, 4 e 5 as medidas de altura, base menor e base maior do segmento trapezoidal respectivamente para o clculo correto das reas e dos ndices. O data.frame tambm deve conter uma coluna chamada Especie para que o usurio possa utilizar o argumento Megaptera. 

Value:

     Retorna um array com a classe, os indivduos e seus respectivos ndices de condio corprea. 

Warning:

Caso a data frame no contenha uma coluna chamada Especie a funo no ir ser executada, bem como se as colunas no tiverem o mesmo comprimento ou se o nmero de colunas do data.frame for menor do que 5.

Author(s):
Moreno Pereira
Email: moreno_pereira@hotmail.com

References:
     Christiansen, F., A. M. Dujon, K. R. Sprogis, J. P. Y. Arnould, and L. Bejder. 2016. Noninvasive unmanned aerial vehicle provides estimates of the energetic cost of reproduction in humpback whales. Ecosphere 7(10):e01468.
10.1002/ecs2.1468

See Also:
Como  calculado o ndice de condio corprea na pgina 6 do artigo acima
   
Examples:

#Exemplo com sada apenas de imaturos
BCI (dados, ad=FALSE, Megaptera=TRUE, rmNA=FALSE)     

#Exemplo utilizando todas as espcies dos dados
BCI (dados, ad=FALSE, Megaptera=FALSE, rmNA=FALSE)
